Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL5A1-AS1Q5SY13 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL5A1-AS1Q5SY13 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms