Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF14Q5SWL7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF14Q5SWL7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF14Q5SWL7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF14Q5SWL7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF14Q5SWL7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF14Q5SWL7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF14Q5SWL7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF14Q5SWL7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF14Q5SWL7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF14Q5SWL7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF14Q5SWL7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF14Q5SWL7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF14Q5SWL7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF14Q5SWL7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF14Q5SWL7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF14Q5SWL7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF14Q5SWL7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms