Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HABP4Q5JVS0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
HABP4Q5JVS0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HABP4Q5JVS0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HABP4Q5JVS0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HABP4Q5JVS0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HABP4Q5JVS0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms