Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQF8

PABPC1L2A, Polyadenylate-binding protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1L2AQ5JQF8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PABPC1L2AQ5JQF8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPC1L2AQ5JQF8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PABPC1L2AQ5JQF8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 421.6 ms