Protein–RNA interactions for Protein: Q4AC94

C2CD3, C2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD3Q4AC94 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C2CD3Q4AC94 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C2CD3Q4AC94 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C2CD3Q4AC94 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C2CD3Q4AC94 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C2CD3Q4AC94 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms