Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LONRF3Q496Y0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LONRF3Q496Y0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LONRF3Q496Y0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LONRF3Q496Y0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms