Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYT16Q17RD7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT16Q17RD7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT16Q17RD7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms