Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX2Q16385 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX2Q16385 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX2Q16385 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX2Q16385 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSX2Q16385 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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