Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYTH1Q15438 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYTH1Q15438 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYTH1Q15438 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH1Q15438 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CYTH1Q15438 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
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