Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.098e-49■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 LINC01029-203ENST00000582805 788 ntTSL 1 (best)16.15■□□□□ 0.181e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZEB2-221ENST00000479735 543 ntTSL 422.77■■□□□ 1.246e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZEB2-231ENST00000630572 468 ntTSL 515.73■□□□□ 0.116e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZEB2-202ENST00000392861 1514 ntTSL 1 (best)14.51□□□□□ -0.096e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZEB2-209ENST00000435831 554 ntTSL 411.78□□□□□ -0.526e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZEB2-220ENST00000476394 601 ntTSL 311.61□□□□□ -0.556e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZEB2-207ENST00000431672 709 ntTSL 410.6□□□□□ -0.716e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZEB2-216ENST00000465308 1071 ntTSL 59.5□□□□□ -0.896e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZEB2-208ENST00000434448 583 ntTSL 59.5□□□□□ -0.896e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZEB2-212ENST00000453352 581 ntTSL 39.18□□□□□ -0.946e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZEB2-222ENST00000484313 845 ntTSL 1 (best)9.03□□□□□ -0.966e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZEB2-211ENST00000444559 577 ntTSL 48.97□□□□□ -0.976e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZEB2-203ENST00000409211 587 ntTSL 47.34□□□□□ -1.236e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZEB2-218ENST00000472146 3837 ntTSL 1 (best)4.56□□□□□ -1.686e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZEB2-213ENST00000461784 751 ntTSL 34.47□□□□□ -1.696e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZEB2-242ENST00000637591 101 ntTSL 50.32□□□□□ -2.366e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 CBFA2T3-204ENST00000563640 664 ntTSL 217.48■□□□□ 0.393e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.33e-6■■□□□ 13.2
SAFBQ15424 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.891e-7■■□□□ 13
SAFBQ15424 ZNF767P-204ENST00000486492 1616 ntTSL 219.4■□□□□ 0.71e-7■■□□□ 13
SAFBQ15424 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.511e-7■■□□□ 13
SAFBQ15424 RPL32P3-205ENST00000507287 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.561e-7■■□□□ 13
SAFBQ15424 RPL32P3-206ENST00000510078 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-7■■□□□ 13
SAFBQ15424 ZNF767P-203ENST00000481762 357 ntTSL 39.11□□□□□ -0.951e-7■■□□□ 13
SAFBQ15424 ZEB2-240ENST00000637267 2677 ntTSL 58.44□□□□□ -1.064e-6■■□□□ 13
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SAFBQ15424 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.11e-7■■□□□ 13
SAFBQ15424 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.561e-7■■□□□ 13
SAFBQ15424 CCDC136-205ENST00000464672 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.53□□□□□ -0.081e-7■■□□□ 13
SAFBQ15424 CCDC136-215ENST00000528772 565 ntTSL 413.66□□□□□ -0.221e-7■■□□□ 13
SAFBQ15424 CCDC136-214ENST00000494552 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.581e-7■■□□□ 13
SAFBQ15424 CCDC136-201ENST00000297788 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.591e-7■■□□□ 13
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SAFBQ15424 CCDC136-209ENST00000480137 3732 ntTSL 29.85□□□□□ -0.831e-7■■□□□ 13
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SAFBQ15424 PLCB1-224ENST00000636319 2930 ntTSL 521.38■■□□□ 1.013e-6■■□□□ 12.9
SAFBQ15424 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.753e-6■■□□□ 12.9
SAFBQ15424 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.753e-6■■□□□ 12.9
SAFBQ15424 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.223e-6■■□□□ 12.9
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SAFBQ15424 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.071e-7■■□□□ 12.8
SAFBQ15424 RNF115-201ENST00000539368 3097 ntTSL 1 (best)6.71□□□□□ -1.331e-7■■□□□ 12.8
SAFBQ15424 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.741e-6■■□□□ 12.8
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SAFBQ15424 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.121e-6■■□□□ 12.8
SAFBQ15424 LINC01287-202ENST00000453187 430 ntTSL 311.95□□□□□ -0.52e-6■■□□□ 12.8
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SAFBQ15424 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.351e-8■■□□□ 12.7
SAFBQ15424 DYRK1A-204ENST00000398960 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51e-8■■□□□ 12.7
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SAFBQ15424 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.971e-8■■□□□ 12.7
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SAFBQ15424 IGF2BP3-208ENST00000469723 556 ntTSL 58.83□□□□□ -12e-10■■□□□ 12.7
SAFBQ15424 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.162e-10■■□□□ 12.7
SAFBQ15424 KNL1-212ENST00000534204 565 ntTSL 413□□□□□ -0.334e-6■■□□□ 12.7
SAFBQ15424 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.994e-6■■□□□ 12.7
SAFBQ15424 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.784e-6■■□□□ 12.7
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SAFBQ15424 KNL1-211ENST00000533001 5923 ntTSL 1 (best)1.97□□□□□ -2.094e-6■■□□□ 12.7
SAFBQ15424 AC087380.1-204ENST00000418729 1026 ntTSL 1 (best)13.89□□□□□ -0.191e-6■■□□□ 12.7
SAFBQ15424 HBG2-203ENST00000380259 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.51e-6■■□□□ 12.7
SAFBQ15424 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.511e-6■■□□□ 12.7
SAFBQ15424 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.71e-6■■□□□ 12.7
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SAFBQ15424 AC087380.1-201ENST00000420465 1001 ntTSL 38.46□□□□□ -1.061e-6■■□□□ 12.7
SAFBQ15424 AC087380.1-203ENST00000420726 752 ntTSL 57□□□□□ -1.291e-6■■□□□ 12.7
SAFBQ15424 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 56.33□□□□□ -1.41e-6■■□□□ 12.7
SAFBQ15424 PLCXD1-208ENST00000445062 555 ntTSL 423.73■■□□□ 1.394e-6■■□□□ 12.6
SAFBQ15424 PLCXD1-205ENST00000429181 469 ntTSL 416.81■□□□□ 0.284e-6■■□□□ 12.6
SAFBQ15424 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.024e-6■■□□□ 12.6
SAFBQ15424 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.764e-7■■□□□ 12.6
SAFBQ15424 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -14e-7■■□□□ 12.6
SAFBQ15424 BDH1-208ENST00000445160 539 ntTSL 523.44■■□□□ 1.344e-7■■□□□ 12.5
SAFBQ15424 BDH1-204ENST00000431056 453 ntTSL 513.18□□□□□ -0.34e-7■■□□□ 12.5
SAFBQ15424 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.984e-7■■□□□ 12.5
SAFBQ15424 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.744e-7■■□□□ 12.5
SAFBQ15424 ABO-201ENST00000453660 6341 ntTSL 1 (best)15.72■□□□□ 0.114e-7■■□□□ 12.5
SAFBQ15424 PLCB1-227ENST00000636825 3020 ntTSL 58.77□□□□□ -1.014e-6■■□□□ 12.5
SAFBQ15424 PLCB1-221ENST00000635830 3237 ntTSL 57.96□□□□□ -1.134e-6■■□□□ 12.5
SAFBQ15424 LINC01287-203ENST00000454441 1007 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.283e-6■■□□□ 12.4
SAFBQ15424 ZNF580-206ENST00000592881 1019 ntTSL 323.73■■□□□ 1.391e-6■■□□□ 12.4
SAFBQ15424 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.121e-6■■□□□ 12.4
SAFBQ15424 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.13e-6■■□□□ 12.4
SAFBQ15424 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.546e-7■■□□□ 12.3
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