Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TLR1Q15399 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR1Q15399 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TLR1Q15399 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TLR1Q15399 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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