Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SF3B3Q15393 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SF3B3Q15393 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SF3B3Q15393 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SF3B3Q15393 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SF3B3Q15393 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SF3B3Q15393 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SF3B3Q15393 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SF3B3Q15393 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SF3B3Q15393 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SF3B3Q15393 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SF3B3Q15393 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SF3B3Q15393 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SF3B3Q15393 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SF3B3Q15393 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SF3B3Q15393 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SF3B3Q15393 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SF3B3Q15393 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
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