Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD3Q15054 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLD3Q15054 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD3Q15054 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLD3Q15054 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLD3Q15054 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLD3Q15054 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLD3Q15054 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD3Q15054 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLD3Q15054 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD3Q15054 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
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