Protein–RNA interactions for Protein: Q14739

LBR, Lamin-B receptor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBRQ14739 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LBRQ14739 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LBRQ14739 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LBRQ14739 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LBRQ14739 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LBRQ14739 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LBRQ14739 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LBRQ14739 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LBRQ14739 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LBRQ14739 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LBRQ14739 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LBRQ14739 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LBRQ14739 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LBRQ14739 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LBRQ14739 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LBRQ14739 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LBRQ14739 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LBRQ14739 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBRQ14739 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBRQ14739 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBRQ14739 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBRQ14739 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LBRQ14739 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBRQ14739 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBRQ14739 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBRQ14739 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBRQ14739 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBRQ14739 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LBRQ14739 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LBRQ14739 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LBRQ14739 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LBRQ14739 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LBRQ14739 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LBRQ14739 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LBRQ14739 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LBRQ14739 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LBRQ14739 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LBRQ14739 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LBRQ14739 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LBRQ14739 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LBRQ14739 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LBRQ14739 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LBRQ14739 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LBRQ14739 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LBRQ14739 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LBRQ14739 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LBRQ14739 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LBRQ14739 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LBRQ14739 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LBRQ14739 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LBRQ14739 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LBRQ14739 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LBRQ14739 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LBRQ14739 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LBRQ14739 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LBRQ14739 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LBRQ14739 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LBRQ14739 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LBRQ14739 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LBRQ14739 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LBRQ14739 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LBRQ14739 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LBRQ14739 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LBRQ14739 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LBRQ14739 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LBRQ14739 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
LBRQ14739 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LBRQ14739 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LBRQ14739 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LBRQ14739 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LBRQ14739 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LBRQ14739 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LBRQ14739 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LBRQ14739 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LBRQ14739 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LBRQ14739 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LBRQ14739 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LBRQ14739 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LBRQ14739 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LBRQ14739 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LBRQ14739 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LBRQ14739 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LBRQ14739 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LBRQ14739 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LBRQ14739 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LBRQ14739 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LBRQ14739 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LBRQ14739 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LBRQ14739 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LBRQ14739 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LBRQ14739 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LBRQ14739 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LBRQ14739 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LBRQ14739 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LBRQ14739 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LBRQ14739 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LBRQ14739 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBRQ14739 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBRQ14739 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBRQ14739 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms