Protein–RNA interactions for Protein: Q14151

SAFB2, Scaffold attachment factor B2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFB2Q14151 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.48e-8■■■□□ 19.2
SAFB2Q14151 RTN4-211ENST00000438462 656 ntTSL 517.28■□□□□ 0.368e-8■■■□□ 19.2
SAFB2Q14151 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.68e-8■■■□□ 19.2
SAFB2Q14151 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.998e-8■■■□□ 19.2
SAFB2Q14151 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.598e-8■■■□□ 19.2
SAFB2Q14151 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.638e-8■■■□□ 19.2
SAFB2Q14151 SCMH1-207ENST00000372597 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.221e-6■■■□□ 19.2
SAFB2Q14151 SCMH1-202ENST00000337495 3108 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.441e-6■■■□□ 19.2
SAFB2Q14151 SCMH1-206ENST00000372596 3323 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.481e-6■■■□□ 19.2
SAFB2Q14151 USP32-208ENST00000589335 691 ntTSL 528.75■■■□□ 2.194e-6■■■□□ 19.1
SAFB2Q14151 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.344e-6■■■□□ 19.1
SAFB2Q14151 USP32-211ENST00000590133 2563 ntTSL 214.5□□□□□ -0.094e-6■■■□□ 19.1
SAFB2Q14151 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.094e-6■■■□□ 19.1
SAFB2Q14151 MON2-205ENST00000547095 5708 ntTSL 1 (best)21.51■■□□□ 1.031e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.031e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.91e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.851e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 MON2-212ENST00000552115 3760 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.171e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 MON2-214ENST00000641654 10382 ntBASIC13.33□□□□□ -0.281e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.761e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.664e-7■■■□□ 19
SAFB2Q14151 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.064e-7■■■□□ 19
SAFB2Q14151 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.074e-7■■■□□ 19
SAFB2Q14151 RFX7-203ENST00000560792 518 ntAPPRIS ALT2 TSL 48.14□□□□□ -1.113e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 RFX7-202ENST00000559847 4165 ntTSL 1 (best)4.93□□□□□ -1.623e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 SRR-207ENST00000576620 522 ntTSL 433.35■■■□□ 2.934e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.934e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 SRR-206ENST00000575840 566 ntTSL 433.35■■■□□ 2.934e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.64e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 PAN3-204ENST00000503791 2443 ntTSL 228.86■■■□□ 2.214e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.74e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.664e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.944e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.764e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC19.3■□□□□ 0.684e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 SRR-203ENST00000572709 298 ntTSL 1 (best)18.89■□□□□ 0.614e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 PROSER2-AS1-201ENST00000445498 3146 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.384e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.014e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 MYEOV-212ENST00000544781 585 ntTSL 212□□□□□ -0.494e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 MYEOV-210ENST00000541137 876 ntTSL 311.26□□□□□ -0.614e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 SRR-205ENST00000574987 577 ntTSL 410.97□□□□□ -0.654e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 MYEOV-208ENST00000540356 442 ntTSL 310.46□□□□□ -0.734e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.254e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.274e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 PROSER2-AS1-202ENST00000453242 475 ntTSL 36.41□□□□□ -1.384e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 SRR-202ENST00000570662 586 ntTSL 55.6□□□□□ -1.514e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.591e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 DNAH14-218ENST00000498360 951 ntTSL 319.56■□□□□ 0.721e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 IQCB1-203ENST00000393650 2253 ntTSL 519.95■□□□□ 0.784e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.434e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 IQCB1-204ENST00000460108 988 ntTSL 517.46■□□□□ 0.394e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 IQCB1-201ENST00000310864 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.084e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 IQCB1-207ENST00000498104 701 ntTSL 314.31□□□□□ -0.124e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.324e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.184e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.924e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 TNK2-210ENST00000433111 580 ntTSL 432.92■■■□□ 2.864e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 TNK2-220ENST00000486523 300 ntTSL 329.89■■■□□ 2.384e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 TNK2-216ENST00000468819 876 ntTSL 1 (best)29.03■■■□□ 2.244e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 TNK2-207ENST00000427576 541 ntTSL 328.96■■■□□ 2.234e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.024e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.024e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 HNRNPUL1-219ENST00000601336 754 ntTSL 227.64■■■□□ 2.024e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.824e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 FAM60A-208ENST00000543615 669 ntTSL 526.17■■□□□ 1.784e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 TNK2-212ENST00000439230 2331 ntTSL 1 (best)24■■□□□ 1.434e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.384e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.144e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.114e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 221.36■■□□□ 1.014e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.944e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 HNRNPUL1-214ENST00000599719 1473 ntTSL 1 (best)20.81■□□□□ 0.924e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 HNRNPUL1-208ENST00000595196 3043 ntTSL 1 (best)20.61■□□□□ 0.894e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 FAM60A-204ENST00000536836 1734 ntTSL 220.34■□□□□ 0.854e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.794e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.734e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.564e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 TNK2-214ENST00000464041 3545 ntTSL 1 (best)17.87■□□□□ 0.454e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.424e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.364e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 HNRNPUL1-218ENST00000601309 672 ntTSL 517.19■□□□□ 0.344e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 AC016949.1-201ENST00000432047 1413 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.34e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 AC244093.4-201ENST00000620689 710 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.294e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.264e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.234e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 216.15■□□□□ 0.184e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 FAM60A-206ENST00000539409 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.144e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.024e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 FAM60A-201ENST00000337682 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.044e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 HNRNPUL1-211ENST00000597725 573 ntTSL 414.65□□□□□ -0.064e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 CAB39-207ENST00000614925 1619 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.524e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 EMSY-216ENST00000533972 452 ntTSL 311.72□□□□□ -0.534e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 EMSY-202ENST00000427574 2415 ntTSL 1 (best)10.85□□□□□ -0.674e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.174e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.224e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.284e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.354e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.374e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.374e-6■■■□□ 19
SAFB2Q14151 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.444e-6■■■□□ 19
Retrieved 100 of 3,296 protein–RNA pairs in 271.1 ms