Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms