Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE1CQ14123 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE1CQ14123 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE1CQ14123 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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