Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL9A2Q14055 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL9A2Q14055 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A2Q14055 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL9A2Q14055 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A2Q14055 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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