Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTAN1Q13813 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTAN1Q13813 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPTAN1Q13813 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTAN1Q13813 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms