Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A4Q13733 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A4Q13733 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1A4Q13733 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A4Q13733 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A4Q13733 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A4Q13733 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A4Q13733 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A4Q13733 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1A4Q13733 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A4Q13733 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A4Q13733 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP1A4Q13733 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A4Q13733 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A4Q13733 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1A4Q13733 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1A4Q13733 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP1A4Q13733 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A4Q13733 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
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