Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SF3B2Q13435 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SF3B2Q13435 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SF3B2Q13435 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SF3B2Q13435 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SF3B2Q13435 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SF3B2Q13435 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SF3B2Q13435 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SF3B2Q13435 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SF3B2Q13435 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SF3B2Q13435 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SF3B2Q13435 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SF3B2Q13435 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SF3B2Q13435 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SF3B2Q13435 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SF3B2Q13435 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SF3B2Q13435 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SF3B2Q13435 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SF3B2Q13435 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SF3B2Q13435 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SF3B2Q13435 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SF3B2Q13435 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SF3B2Q13435 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SF3B2Q13435 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SF3B2Q13435 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SF3B2Q13435 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SF3B2Q13435 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SF3B2Q13435 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SF3B2Q13435 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SF3B2Q13435 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SF3B2Q13435 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SF3B2Q13435 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SF3B2Q13435 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
SF3B2Q13435 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SF3B2Q13435 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SF3B2Q13435 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SF3B2Q13435 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SF3B2Q13435 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SF3B2Q13435 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SF3B2Q13435 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SF3B2Q13435 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SF3B2Q13435 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SF3B2Q13435 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SF3B2Q13435 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SF3B2Q13435 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SF3B2Q13435 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
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