Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXC1Q12948 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXC1Q12948 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXC1Q12948 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXC1Q12948 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXC1Q12948 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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