Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAF2Q12933 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF2Q12933 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF2Q12933 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRAF2Q12933 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms