Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms