Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 ERO1YML130C 1692 nt7.68□□□□□ -1.18
SNF8Q12483 MET22YOL064C 1074 nt7.67□□□□□ -1.18
SNF8Q12483 YCR025CYCR025C 411 nt7.66□□□□□ -1.18
SNF8Q12483 YLR460CYLR460C 1131 nt7.66□□□□□ -1.18
SNF8Q12483 PAU19YMR325W 375 nt7.66□□□□□ -1.18
SNF8Q12483 snR4snR4 186 nt7.66□□□□□ -1.18
SNF8Q12483 SER2YGR208W 930 nt7.65□□□□□ -1.18
SNF8Q12483 YLR173WYLR173W 1827 nt7.64□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 BUD31YCR063W 474 nt7.64□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 CHS7YHR142W 951 nt7.64□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 LRO1YNR008W 1986 nt7.64□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 PDC6YGR087C 1692 nt7.63□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 EHT1YBR177C 1356 nt7.63□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 DIA4YHR011W 1341 nt7.63□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 DIP5YPL265W 1827 nt7.62□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 OCH1YGL038C 1443 nt7.61□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 DUS3YLR401C 2007 nt7.61□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 GLY1YEL046C 1164 nt7.61□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 INO1YJL153C 1602 nt7.6□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 HTS1YPR033C 1641 nt7.6□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 MRN1YPL184C 1839 nt7.6□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 YGR210CYGR210C 1236 nt7.6□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 YMR166CYMR166C 1107 nt7.6□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 OLA1YBR025C 1185 nt7.6□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 RTG2YGL252C 1767 nt7.6□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 MDL2YPL270W 2322 nt7.6□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 TIF3YPR163C 1311 nt7.59□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 NAP1YKR048C 1254 nt7.59□□□□□ -1.19
SNF8Q12483 CAK1YFL029C 1107 nt7.58□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 NDE2YDL085W 1638 nt7.58□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 TGL5YOR081C 2250 nt7.57□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 TDA4YJR116W 840 nt7.57□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 YNL140CYNL140C 570 nt7.57□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 YPL108WYPL108W 507 nt7.57□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 ADE16YLR028C 1776 nt7.56□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.56□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.56□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.56□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.56□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.56□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 SWM1YDR260C 513 nt7.56□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 WSC4YHL028W 1818 nt7.56□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 POP2YNR052C 1302 nt7.55□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 INM1YHR046C 888 nt7.55□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 RCF1YML030W 480 nt7.55□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 PUP1YOR157C 786 nt7.55□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 RHO1YPR165W 630 nt7.55□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 SHC1YER096W 1539 nt7.55□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 PUP3YER094C 618 nt7.54□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 RRT14YIL127C 621 nt7.53□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 GNP1YDR508C 1992 nt7.53□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 ALG7YBR243C 1347 nt7.52□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 YDR306CYDR306C 1437 nt7.52□□□□□ -1.2
SNF8Q12483 FIT1YDR534C 1587 nt7.52□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 ARO3YDR035W 1113 nt7.52□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 LSP1YPL004C 1026 nt7.52□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 HXT8YJL214W 1710 nt7.52□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 WSC3YOL105C 1671 nt7.51□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 THI73YLR004C 1572 nt7.49□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 MRP7YNL005C 1116 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 SLG1YOR008C 1137 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 SAM50YNL026W 1455 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 ADE2YOR128C 1716 nt7.47□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 YCP4YCR004C 744 nt7.47□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 PET18YCR020C 648 nt7.47□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.47□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 MDH2YOL126C 1134 nt7.47□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 KTR4YBR199W 1395 nt7.46□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 PMT7YDR307W 1989 nt7.46□□□□□ -1.21
SNF8Q12483 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.46□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 YJL160CYJL160C 864 nt7.46□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 FCY1YPR062W 477 nt7.46□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 SNU66YOR308C 1764 nt7.46□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 PFS2YNL317W 1398 nt7.46□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 MET13YGL125W 1803 nt7.45□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 YER156CYER156C 1017 nt7.45□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 YGR137WYGR137W 375 nt7.45□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 BXI1YNL305C 894 nt7.45□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 TIM50YPL063W 1431 nt7.44□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 PMT1YDL095W 2454 nt7.44□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 GCD11YER025W 1584 nt7.44□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.44□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.44□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.44□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 YPT31YER031C 672 nt7.43□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 UFD1YGR048W 1086 nt7.43□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 ELP6YMR312W 822 nt7.43□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 HSV2YGR223C 1347 nt7.43□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 PRE10YOR362C 867 nt7.41□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 RPS6AYPL090C 711 nt7.41□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 RPS6BYBR181C 711 nt7.41□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 JHD1YER051W 1479 nt7.41□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 TPO1YLL028W 1761 nt7.41□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 SNP1YIL061C 903 nt7.4□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 YMR007WYMR007W 381 nt7.4□□□□□ -1.22
SNF8Q12483 ATP2YJR121W 1536 nt7.39□□□□□ -1.23
SNF8Q12483 PUS7YOR243C 2031 nt7.39□□□□□ -1.23
SNF8Q12483 SLM3YDL033C 1254 nt7.38□□□□□ -1.23
SNF8Q12483 ALR1YOL130W 2580 nt7.38□□□□□ -1.23
SNF8Q12483 MTC6YHR151C 1581 nt7.37□□□□□ -1.23
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