Protein–RNA interactions for Protein: Q12039

HMI1, ATP-dependent DNA helicase HMI1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMI1Q12039 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.77□□□□□ -1.01
HMI1Q12039 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.77□□□□□ -1.01
HMI1Q12039 MDL2YPL270W 2322 nt8.76□□□□□ -1.01
HMI1Q12039 FLX1YIL134W 936 nt8.76□□□□□ -1.01
HMI1Q12039 PAM17YKR065C 594 nt8.76□□□□□ -1.01
HMI1Q12039 IPL1YPL209C 1104 nt8.76□□□□□ -1.01
HMI1Q12039 YIR035CYIR035C 765 nt8.75□□□□□ -1.01
HMI1Q12039 DUS3YLR401C 2007 nt8.75□□□□□ -1.01
HMI1Q12039 YCR025CYCR025C 411 nt8.74□□□□□ -1.01
HMI1Q12039 MAS1YLR163C 1389 nt8.73□□□□□ -1.01
HMI1Q12039 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt8.72□□□□□ -1.01
HMI1Q12039 INO1YJL153C 1602 nt8.72□□□□□ -1.01
HMI1Q12039 YCP4YCR004C 744 nt8.7□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 YLR280CYLR280C 351 nt8.7□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 CYC3YAL039C 810 nt8.68□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 YLR460CYLR460C 1131 nt8.68□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 DIA4YHR011W 1341 nt8.68□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 POP2YNR052C 1302 nt8.68□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 BUD31YCR063W 474 nt8.67□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 GCD11YER025W 1584 nt8.67□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 YIA6YIL006W 1122 nt8.67□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 ADE16YLR028C 1776 nt8.67□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 RNA170RNA170 169 nt8.67□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 RIB1YBL033C 1038 nt8.67□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 SAM50YNL026W 1455 nt8.67□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 ALR1YOL130W 2580 nt8.66□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 NDE2YDL085W 1638 nt8.65□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 SRP102YKL154W 735 nt8.65□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 MET22YOL064C 1074 nt8.65□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 MRN1YPL184C 1839 nt8.65□□□□□ -1.02
HMI1Q12039 ADE2YOR128C 1716 nt8.65□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 ERO1YML130C 1692 nt8.65□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 LRO1YNR008W 1986 nt8.64□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 TIF3YPR163C 1311 nt8.64□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 YNL140CYNL140C 570 nt8.64□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 FIT1YDR534C 1587 nt8.64□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 SNU66YOR308C 1764 nt8.63□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 SOD2YHR008C 702 nt8.63□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 CHS7YHR142W 951 nt8.63□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 GNP1YDR508C 1992 nt8.62□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 EHT1YBR177C 1356 nt8.62□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 DIP5YPL265W 1827 nt8.62□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 GLY1YEL046C 1164 nt8.62□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 ARA2YMR041C 1008 nt8.62□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 OLA1YBR025C 1185 nt8.62□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 TGL5YOR081C 2250 nt8.61□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 INM1YHR046C 888 nt8.61□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 ERG6YML008C 1152 nt8.61□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 UFD1YGR048W 1086 nt8.6□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 MDH2YOL126C 1134 nt8.59□□□□□ -1.03
HMI1Q12039 OCH1YGL038C 1443 nt8.58□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.58□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.58□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.58□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.58□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.58□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 SWM1YDR260C 513 nt8.58□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 SER2YGR208W 930 nt8.58□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 TDA4YJR116W 840 nt8.58□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 RHO1YPR165W 630 nt8.58□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 PDC6YGR087C 1692 nt8.58□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 HSV2YGR223C 1347 nt8.57□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 PFS2YNL317W 1398 nt8.57□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 LPD1YFL018C 1500 nt8.56□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 YJR154WYJR154W 1041 nt8.56□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 MRP7YNL005C 1116 nt8.56□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 WSC4YHL028W 1818 nt8.56□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 SHC1YER096W 1539 nt8.55□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 ARO3YDR035W 1113 nt8.55□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 CAK1YFL029C 1107 nt8.55□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 YGR210CYGR210C 1236 nt8.55□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 RCF1YML030W 480 nt8.55□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 THI73YLR004C 1572 nt8.55□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 ALG7YBR243C 1347 nt8.54□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 YMR166CYMR166C 1107 nt8.54□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 HTS1YPR033C 1641 nt8.54□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 MAM3YOL060C 2121 nt8.53□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 YLR122CYLR122C 378 nt8.53□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 ECM10YEL030W 1935 nt8.52□□□□□ -1.04
HMI1Q12039 YMR007WYMR007W 381 nt8.52□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 LSP1YPL004C 1026 nt8.52□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 KTR4YBR199W 1395 nt8.51□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 WSC3YOL105C 1671 nt8.51□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 PUP3YER094C 618 nt8.51□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 PMT7YDR307W 1989 nt8.51□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 HXT8YJL214W 1710 nt8.51□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt8.5□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 RCR1YBR005W 642 nt8.49□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 YPL108WYPL108W 507 nt8.49□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 FCY1YPR062W 477 nt8.49□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 RPL2AYFR031C-A 765 nt8.48□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 YGR137WYGR137W 375 nt8.48□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 MTC6YHR151C 1581 nt8.48□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 MET13YGL125W 1803 nt8.47□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 ELP6YMR312W 822 nt8.47□□□□□ -1.05
HMI1Q12039 SNP1YIL061C 903 nt8.46□□□□□ -1.06
HMI1Q12039 Q0010Q0010 387 nt8.46□□□□□ -1.06
HMI1Q12039 SLM3YDL033C 1254 nt8.45□□□□□ -1.06
HMI1Q12039 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.45□□□□□ -1.06
HMI1Q12039 YPT31YER031C 672 nt8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 95.6 ms