Protein–RNA interactions for Protein: Q09327

MGAT3, Beta-1,4-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT3Q09327 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MGAT3Q09327 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MGAT3Q09327 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MGAT3Q09327 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MGAT3Q09327 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MGAT3Q09327 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MGAT3Q09327 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MGAT3Q09327 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MGAT3Q09327 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MGAT3Q09327 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MGAT3Q09327 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MGAT3Q09327 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MGAT3Q09327 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MGAT3Q09327 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MGAT3Q09327 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MGAT3Q09327 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MGAT3Q09327 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MGAT3Q09327 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms