Protein–RNA interactions for Protein: Q08474

VAM10, Vacuolar morphogenesis protein 10, yeastyeast

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM10Q08474 YMR166CYMR166C 1107 nt5.92□□□□□ -1.46
VAM10Q08474 LSP1YPL004C 1026 nt5.92□□□□□ -1.46
VAM10Q08474 AAC3YBR085W 924 nt5.92□□□□□ -1.46
VAM10Q08474 snR4snR4 186 nt5.92□□□□□ -1.46
VAM10Q08474 TMS1YDR105C 1422 nt5.91□□□□□ -1.46
VAM10Q08474 YLR072WYLR072W 2082 nt5.91□□□□□ -1.46
VAM10Q08474 YJR149WYJR149W 1215 nt5.91□□□□□ -1.46
VAM10Q08474 BUB2YMR055C 921 nt5.9□□□□□ -1.46
VAM10Q08474 snR86snR86 1004 nt5.89□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 RRT14YIL127C 621 nt5.89□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 ADE16YLR028C 1776 nt5.88□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 MET22YOL064C 1074 nt5.88□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 DIA4YHR011W 1341 nt5.88□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 OCH1YGL038C 1443 nt5.88□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 YPT31YER031C 672 nt5.87□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 CAK1YFL029C 1107 nt5.87□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 ERG6YML008C 1152 nt5.87□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 LEA1YPL213W 717 nt5.87□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 POP2YNR052C 1302 nt5.87□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 FTH1YBR207W 1398 nt5.87□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 FIT1YDR534C 1587 nt5.87□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 DUS3YLR401C 2007 nt5.87□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 YRF1-1YDR545W 5391 nt5.85□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 YRF1-5YLR467W 5391 nt5.85□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 YRF1-8YOR396W 5391 nt5.85□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 YPR084WYPR084W 1371 nt5.85□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 UFD1YGR048W 1086 nt5.85□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 PDC6YGR087C 1692 nt5.85□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 YMR206WYMR206W 942 nt5.84□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 HIS3YOR202W 663 nt5.84□□□□□ -1.47
VAM10Q08474 MFT1YML062C 1179 nt5.83□□□□□ -1.48
VAM10Q08474 GTB1YDR221W 2109 nt5.83□□□□□ -1.48
VAM10Q08474 YJL160CYJL160C 864 nt5.82□□□□□ -1.48
VAM10Q08474 RHO1YPR165W 630 nt5.82□□□□□ -1.48
VAM10Q08474 ABP1YCR088W 1779 nt5.8□□□□□ -1.48
VAM10Q08474 YBR056WYBR056W 1506 nt5.8□□□□□ -1.48
VAM10Q08474 YGR137WYGR137W 375 nt5.8□□□□□ -1.48
VAM10Q08474 RNA170RNA170 169 nt5.8□□□□□ -1.48
VAM10Q08474 THI73YLR004C 1572 nt5.8□□□□□ -1.48
VAM10Q08474 PFS2YNL317W 1398 nt5.8□□□□□ -1.48
VAM10Q08474 MEP1YGR121C 1479 nt5.78□□□□□ -1.48
VAM10Q08474 NDE2YDL085W 1638 nt5.78□□□□□ -1.48
VAM10Q08474 MDH2YOL126C 1134 nt5.78□□□□□ -1.48
VAM10Q08474 PUP3YER094C 618 nt5.77□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 TIF3YPR163C 1311 nt5.76□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 PET18YCR020C 648 nt5.76□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 GRH1YDR517W 1119 nt5.76□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 YER152W-AYER152W-A 567 nt5.76□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 YER156CYER156C 1017 nt5.76□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 PMU1YKL128C 888 nt5.76□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 HSV2YGR223C 1347 nt5.75□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt5.75□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 RCF1YML030W 480 nt5.75□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 YNL140CYNL140C 570 nt5.75□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 PRE10YOR362C 867 nt5.75□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 RPS6AYPL090C 711 nt5.75□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 RPS6BYBR181C 711 nt5.75□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 SLM3YDL033C 1254 nt5.74□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 MRP1YDR347W 966 nt5.74□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 HRA1HRA1 564 nt5.74□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 BXI1YNL305C 894 nt5.74□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 EHT1YBR177C 1356 nt5.74□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 INO1YJL153C 1602 nt5.74□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 BUD31YCR063W 474 nt5.73□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 WSC3YOL105C 1671 nt5.72□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 ESBP6YNL125C 2022 nt5.72□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 GDH1YOR375C 1365 nt5.72□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 TDA4YJR116W 840 nt5.72□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 BUD20YLR074C 501 nt5.72□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 LPD1YFL018C 1500 nt5.72□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 LRO1YNR008W 1986 nt5.71□□□□□ -1.49
VAM10Q08474 GLY1YEL046C 1164 nt5.71□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 INM1YHR046C 888 nt5.71□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 TDH1YJL052W 999 nt5.71□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 ILV2YMR108W 2064 nt5.71□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 ADA2YDR448W 1305 nt5.71□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 TGL5YOR081C 2250 nt5.71□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 ATP2YJR121W 1536 nt5.7□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 PMT7YDR307W 1989 nt5.7□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 TAD2YJL035C 753 nt5.7□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 TIM50YPL063W 1431 nt5.69□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt5.69□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 UTR5YEL035C 501 nt5.69□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 YOR343CYOR343C 327 nt5.69□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 PAU21YOR394W 495 nt5.69□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 PAU22YPL282C 495 nt5.69□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 RPL2AYFR031C-A 765 nt5.68□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 SHC1YER096W 1539 nt5.68□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 MRN1YPL184C 1839 nt5.67□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 JHD1YER051W 1479 nt5.67□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 HXT8YJL214W 1710 nt5.67□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 YIL168WYIL168W 384 nt5.66□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 MRP7YNL005C 1116 nt5.66□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 MNN9YPL050C 1188 nt5.66□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 ELP4YPL101W 1371 nt5.66□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt5.65□□□□□ -1.5
VAM10Q08474 ARG7YMR062C 1326 nt5.65□□□□□ -1.51
VAM10Q08474 DIP5YPL265W 1827 nt5.64□□□□□ -1.51
VAM10Q08474 AIM34YMR003W 597 nt5.64□□□□□ -1.51
VAM10Q08474 RFC1YOR217W 2586 nt5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.4 ms