Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDSRQ06136 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KDSRQ06136 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDSRQ06136 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDSRQ06136 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDSRQ06136 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDSRQ06136 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDSRQ06136 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDSRQ06136 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDSRQ06136 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDSRQ06136 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDSRQ06136 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDSRQ06136 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KDSRQ06136 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDSRQ06136 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDSRQ06136 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms