Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRSF11Q05519 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRSF11Q05519 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRSF11Q05519 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms