Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 SDS24YBR214W 1584 nt7.15□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 MET1YKR069W 1782 nt7.15□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 ECM10YEL030W 1935 nt7.14□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 YBL095WYBL095W 813 nt7.14□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 YPL041CYPL041C 624 nt7.14□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 YJL045WYJL045W 1905 nt7.13□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 FTH1YBR207W 1398 nt7.13□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 REX2YLR059C 810 nt7.13□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 AAT1YKL106W 1356 nt7.12□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 POP2YNR052C 1302 nt7.12□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 SRP102YKL154W 735 nt7.12□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.12□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 HTS1YPR033C 1641 nt7.12□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 ENO1YGR254W 1314 nt7.11□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 snR4snR4 186 nt7.11□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 VBA3YCL069W 1377 nt7.1□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 KGD2YDR148C 1392 nt7.1□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 YKL053WYKL053W 375 nt7.1□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 EMC3YKL207W 762 nt7.1□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 YMR007WYMR007W 381 nt7.1□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 YMR210WYMR210W 1350 nt7.09□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 STF1YDL130W-A 261 nt7.09□□□□□ -1.27
SKO1Q02100 SRP54YPR088C 1626 nt7.09□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.07□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 SAN1YDR143C 1833 nt7.07□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 ECM27YJR106W 2178 nt7.07□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 ADE16YLR028C 1776 nt7.07□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 ERO1YML130C 1692 nt7.06□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 ABP1YCR088W 1779 nt7.06□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.06□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 YLR280CYLR280C 351 nt7.06□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 RCR1YBR005W 642 nt7.06□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 LPD1YFL018C 1500 nt7.06□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 YGR210CYGR210C 1236 nt7.05□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 YPT11YNL304W 1254 nt7.05□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 GGA2YHR108W 1758 nt7.05□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 DIA4YHR011W 1341 nt7.04□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 GUT1YHL032C 2130 nt7.03□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.03□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.03□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.03□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.03□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.03□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 YFR020WYFR020W 699 nt7.03□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 LEA1YPL213W 717 nt7.03□□□□□ -1.28
SKO1Q02100 YMC2YBR104W 990 nt7.02□□□□□ -1.29
SKO1Q02100 PFS2YNL317W 1398 nt7□□□□□ -1.29
SKO1Q02100 snR86snR86 1004 nt7□□□□□ -1.29
SKO1Q02100 YPL108WYPL108W 507 nt7□□□□□ -1.29
SKO1Q02100 PMT7YDR307W 1989 nt7□□□□□ -1.29
SKO1Q02100 FCY1YPR062W 477 nt6.98□□□□□ -1.29
SKO1Q02100 YKR023WYKR023W 1593 nt6.98□□□□□ -1.29
SKO1Q02100 GAS1YMR307W 1680 nt6.97□□□□□ -1.29
SKO1Q02100 YRF1-1YDR545W 5391 nt6.97□□□□□ -1.29
SKO1Q02100 YRF1-5YLR467W 5391 nt6.97□□□□□ -1.29
SKO1Q02100 YRF1-8YOR396W 5391 nt6.97□□□□□ -1.29
SKO1Q02100 SBP1YHL034C 885 nt6.97□□□□□ -1.29
SKO1Q02100 MRS4YKR052C 915 nt6.97□□□□□ -1.29
SKO1Q02100 LAS17YOR181W 1902 nt6.97□□□□□ -1.29
SKO1Q02100 RSM7YJR113C 744 nt6.96□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 MDH2YOL126C 1134 nt6.96□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 PTC6YCR079W 1329 nt6.96□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 YJL160CYJL160C 864 nt6.95□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 BUD20YLR074C 501 nt6.95□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 HSV2YGR223C 1347 nt6.95□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 YNL190WYNL190W 615 nt6.94□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 YMR166CYMR166C 1107 nt6.93□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 HIS3YOR202W 663 nt6.93□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 HDA1YNL021W 2121 nt6.92□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 PAU21YOR394W 495 nt6.92□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 PAU22YPL282C 495 nt6.92□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 SLM3YDL033C 1254 nt6.91□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 YOR343CYOR343C 327 nt6.91□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 TMS1YDR105C 1422 nt6.91□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 MET30YIL046W 1923 nt6.9□□□□□ -1.3
SKO1Q02100 ITR1YDR497C 1755 nt6.9□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 GRH1YDR517W 1119 nt6.89□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 AIM34YMR003W 597 nt6.89□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 LSP1YPL004C 1026 nt6.89□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 ATG22YCL038C 1587 nt6.89□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 YBR056WYBR056W 1506 nt6.88□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 YLR460CYLR460C 1131 nt6.88□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 UBP13YBL067C 2244 nt6.88□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 RRT14YIL127C 621 nt6.87□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 HRA1HRA1 564 nt6.87□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 IDP3YNL009W 1263 nt6.87□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 PMA2YPL036W 2844 nt6.87□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 MET13YGL125W 1803 nt6.87□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 PET18YCR020C 648 nt6.86□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 CAK1YFL029C 1107 nt6.86□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 OCH1YGL038C 1443 nt6.85□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 MRN1YPL184C 1839 nt6.85□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 MRP1YDR347W 966 nt6.85□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 COG1YGL223C 1254 nt6.85□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 CHS7YHR142W 951 nt6.85□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 PRC1YMR297W 1599 nt6.85□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 RPL12BYDR418W 498 nt6.84□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 YER156CYER156C 1017 nt6.84□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 FAF1YIL019W 1041 nt6.84□□□□□ -1.31
SKO1Q02100 MET22YOL064C 1074 nt6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.6 ms