Protein–RNA interactions for Protein: P84077

ARF1, ADP-ribosylation factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1P84077 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF1P84077 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF1P84077 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF1P84077 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF1P84077 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF1P84077 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARF1P84077 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ARF1P84077 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARF1P84077 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF1P84077 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARF1P84077 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARF1P84077 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF1P84077 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF1P84077 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF1P84077 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF1P84077 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF1P84077 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF1P84077 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARF1P84077 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF1P84077 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF1P84077 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARF1P84077 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF1P84077 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF1P84077 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF1P84077 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF1P84077 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARF1P84077 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF1P84077 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF1P84077 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF1P84077 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF1P84077 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF1P84077 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF1P84077 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARF1P84077 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARF1P84077 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARF1P84077 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARF1P84077 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF1P84077 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF1P84077 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF1P84077 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF1P84077 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF1P84077 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF1P84077 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF1P84077 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF1P84077 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF1P84077 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF1P84077 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF1P84077 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF1P84077 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF1P84077 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF1P84077 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF1P84077 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF1P84077 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF1P84077 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF1P84077 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF1P84077 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF1P84077 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF1P84077 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF1P84077 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF1P84077 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF1P84077 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF1P84077 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF1P84077 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF1P84077 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF1P84077 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF1P84077 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARF1P84077 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF1P84077 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF1P84077 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF1P84077 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF1P84077 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF1P84077 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF1P84077 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF1P84077 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF1P84077 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF1P84077 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF1P84077 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF1P84077 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF1P84077 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF1P84077 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF1P84077 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF1P84077 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF1P84077 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF1P84077 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF1P84077 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF1P84077 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF1P84077 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF1P84077 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF1P84077 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF1P84077 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF1P84077 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF1P84077 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF1P84077 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF1P84077 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF1P84077 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF1P84077 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF1P84077 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF1P84077 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARF1P84077 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF1P84077 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms