Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM258P61165 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM258P61165 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM258P61165 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms