Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY3P57055 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIPPLY3P57055 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RIPPLY3P57055 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIPPLY3P57055 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIPPLY3P57055 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIPPLY3P57055 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms