Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN17P56750 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDN17P56750 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN17P56750 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN17P56750 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN17P56750 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN17P56750 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN17P56750 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN17P56750 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN17P56750 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN17P56750 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN17P56750 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms