Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPHB4P54760 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EPHB4P54760 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EPHB4P54760 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EPHB4P54760 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EPHB4P54760 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPHB4P54760 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPHB4P54760 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPHB4P54760 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPHB4P54760 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EPHB4P54760 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EPHB4P54760 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EPHB4P54760 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EPHB4P54760 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EPHB4P54760 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EPHB4P54760 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EPHB4P54760 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EPHB4P54760 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EPHB4P54760 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms