Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LUMP51884 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LUMP51884 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LUMP51884 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LUMP51884 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LUMP51884 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LUMP51884 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LUMP51884 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LUMP51884 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LUMP51884 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LUMP51884 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LUMP51884 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LUMP51884 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LUMP51884 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LUMP51884 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LUMP51884 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LUMP51884 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LUMP51884 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LUMP51884 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LUMP51884 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LUMP51884 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LUMP51884 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LUMP51884 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LUMP51884 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LUMP51884 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LUMP51884 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LUMP51884 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LUMP51884 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LUMP51884 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LUMP51884 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LUMP51884 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LUMP51884 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LUMP51884 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LUMP51884 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LUMP51884 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LUMP51884 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LUMP51884 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LUMP51884 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LUMP51884 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LUMP51884 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LUMP51884 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LUMP51884 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LUMP51884 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LUMP51884 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LUMP51884 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LUMP51884 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LUMP51884 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LUMP51884 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LUMP51884 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LUMP51884 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LUMP51884 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LUMP51884 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LUMP51884 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LUMP51884 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LUMP51884 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LUMP51884 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LUMP51884 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LUMP51884 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LUMP51884 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LUMP51884 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LUMP51884 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LUMP51884 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LUMP51884 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LUMP51884 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LUMP51884 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LUMP51884 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LUMP51884 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LUMP51884 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LUMP51884 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LUMP51884 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LUMP51884 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LUMP51884 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LUMP51884 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LUMP51884 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LUMP51884 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LUMP51884 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LUMP51884 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LUMP51884 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LUMP51884 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LUMP51884 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LUMP51884 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LUMP51884 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LUMP51884 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LUMP51884 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LUMP51884 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LUMP51884 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LUMP51884 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LUMP51884 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LUMP51884 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LUMP51884 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LUMP51884 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LUMP51884 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LUMP51884 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LUMP51884 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LUMP51884 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LUMP51884 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LUMP51884 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LUMP51884 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LUMP51884 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LUMP51884 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms