Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSEN2P49810 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSEN2P49810 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSEN2P49810 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSEN2P49810 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSEN2P49810 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSEN2P49810 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSEN2P49810 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PSEN2P49810 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSEN2P49810 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSEN2P49810 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSEN2P49810 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSEN2P49810 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSEN2P49810 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PSEN2P49810 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSEN2P49810 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSEN2P49810 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PSEN2P49810 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSEN2P49810 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms