Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLK1P49759 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLK1P49759 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK1P49759 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK1P49759 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK1P49759 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK1P49759 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK1P49759 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK1P49759 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK1P49759 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK1P49759 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK1P49759 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK1P49759 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK1P49759 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK1P49759 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK1P49759 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK1P49759 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK1P49759 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLK1P49759 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLK1P49759 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLK1P49759 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLK1P49759 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLK1P49759 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLK1P49759 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLK1P49759 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLK1P49759 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLK1P49759 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLK1P49759 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLK1P49759 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLK1P49759 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLK1P49759 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLK1P49759 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLK1P49759 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK1P49759 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK1P49759 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK1P49759 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK1P49759 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK1P49759 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK1P49759 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK1P49759 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK1P49759 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLK1P49759 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLK1P49759 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLK1P49759 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLK1P49759 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLK1P49759 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLK1P49759 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLK1P49759 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLK1P49759 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLK1P49759 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLK1P49759 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLK1P49759 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLK1P49759 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLK1P49759 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLK1P49759 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLK1P49759 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLK1P49759 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLK1P49759 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLK1P49759 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLK1P49759 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLK1P49759 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLK1P49759 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLK1P49759 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLK1P49759 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLK1P49759 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLK1P49759 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLK1P49759 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLK1P49759 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLK1P49759 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLK1P49759 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLK1P49759 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLK1P49759 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLK1P49759 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLK1P49759 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLK1P49759 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLK1P49759 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK1P49759 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK1P49759 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK1P49759 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK1P49759 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLK1P49759 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLK1P49759 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLK1P49759 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLK1P49759 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLK1P49759 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLK1P49759 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLK1P49759 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLK1P49759 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK1P49759 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK1P49759 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK1P49759 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK1P49759 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK1P49759 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK1P49759 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK1P49759 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK1P49759 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK1P49759 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK1P49759 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK1P49759 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK1P49759 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms