Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM2P49643 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM2P49643 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRIM2P49643 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM2P49643 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRIM2P49643 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRIM2P49643 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms