Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJA8P48165 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJA8P48165 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJA8P48165 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJA8P48165 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJA8P48165 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
GJA8P48165 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GJA8P48165 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJA8P48165 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GJA8P48165 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJA8P48165 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJA8P48165 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJA8P48165 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJA8P48165 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJA8P48165 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJA8P48165 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJA8P48165 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJA8P48165 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GJA8P48165 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GJA8P48165 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJA8P48165 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJA8P48165 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJA8P48165 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJA8P48165 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJA8P48165 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJA8P48165 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJA8P48165 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJA8P48165 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJA8P48165 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJA8P48165 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA8P48165 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA8P48165 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA8P48165 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA8P48165 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA8P48165 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA8P48165 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA8P48165 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA8P48165 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJA8P48165 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJA8P48165 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GJA8P48165 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJA8P48165 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJA8P48165 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJA8P48165 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJA8P48165 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJA8P48165 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJA8P48165 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJA8P48165 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJA8P48165 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJA8P48165 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJA8P48165 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GJA8P48165 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJA8P48165 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJA8P48165 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJA8P48165 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJA8P48165 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GJA8P48165 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJA8P48165 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJA8P48165 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJA8P48165 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GJA8P48165 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GJA8P48165 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
GJA8P48165 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GJA8P48165 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GJA8P48165 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GJA8P48165 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJA8P48165 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJA8P48165 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJA8P48165 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJA8P48165 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJA8P48165 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJA8P48165 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJA8P48165 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJA8P48165 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GJA8P48165 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJA8P48165 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJA8P48165 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GJA8P48165 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJA8P48165 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJA8P48165 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJA8P48165 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GJA8P48165 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJA8P48165 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJA8P48165 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJA8P48165 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJA8P48165 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJA8P48165 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJA8P48165 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJA8P48165 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJA8P48165 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJA8P48165 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJA8P48165 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GJA8P48165 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJA8P48165 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GJA8P48165 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GJA8P48165 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA8P48165 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA8P48165 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA8P48165 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA8P48165 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms