Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
UTRNP46939 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
UTRNP46939 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
UTRNP46939 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
UTRNP46939 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
UTRNP46939 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
UTRNP46939 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
UTRNP46939 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
UTRNP46939 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
UTRNP46939 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
UTRNP46939 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
UTRNP46939 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
UTRNP46939 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
UTRNP46939 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
UTRNP46939 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
UTRNP46939 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
UTRNP46939 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
UTRNP46939 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
UTRNP46939 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
UTRNP46939 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
UTRNP46939 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
UTRNP46939 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
UTRNP46939 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
UTRNP46939 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
UTRNP46939 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
UTRNP46939 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
UTRNP46939 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
UTRNP46939 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
UTRNP46939 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
UTRNP46939 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
UTRNP46939 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
UTRNP46939 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
UTRNP46939 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
UTRNP46939 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
UTRNP46939 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
UTRNP46939 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
UTRNP46939 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
UTRNP46939 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
UTRNP46939 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
UTRNP46939 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
UTRNP46939 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
UTRNP46939 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
UTRNP46939 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
UTRNP46939 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
UTRNP46939 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
UTRNP46939 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
UTRNP46939 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
UTRNP46939 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
UTRNP46939 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
UTRNP46939 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
UTRNP46939 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
UTRNP46939 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
UTRNP46939 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
UTRNP46939 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
UTRNP46939 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
UTRNP46939 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
UTRNP46939 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
UTRNP46939 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
UTRNP46939 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
UTRNP46939 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
UTRNP46939 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
UTRNP46939 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
UTRNP46939 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
UTRNP46939 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
UTRNP46939 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
UTRNP46939 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
UTRNP46939 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
UTRNP46939 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
UTRNP46939 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
UTRNP46939 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
UTRNP46939 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
UTRNP46939 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
UTRNP46939 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
UTRNP46939 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
UTRNP46939 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
UTRNP46939 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
UTRNP46939 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
UTRNP46939 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
UTRNP46939 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
UTRNP46939 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
UTRNP46939 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
UTRNP46939 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
UTRNP46939 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
UTRNP46939 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
UTRNP46939 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
UTRNP46939 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
UTRNP46939 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
UTRNP46939 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
UTRNP46939 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
UTRNP46939 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
UTRNP46939 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
UTRNP46939 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
UTRNP46939 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
UTRNP46939 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
UTRNP46939 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
UTRNP46939 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
UTRNP46939 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
UTRNP46939 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
UTRNP46939 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
UTRNP46939 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms