Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGER3P43115 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGER3P43115 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGER3P43115 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTGER3P43115 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGER3P43115 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms