Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP62P37198 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP62P37198 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP62P37198 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP62P37198 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP62P37198 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP62P37198 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP62P37198 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP62P37198 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP62P37198 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP62P37198 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP62P37198 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP62P37198 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP62P37198 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP62P37198 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP62P37198 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP62P37198 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP62P37198 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP62P37198 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP62P37198 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP62P37198 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP62P37198 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP62P37198 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP62P37198 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP62P37198 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP62P37198 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP62P37198 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP62P37198 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP62P37198 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP62P37198 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP62P37198 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NUP62P37198 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP62P37198 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP62P37198 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP62P37198 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP62P37198 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP62P37198 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP62P37198 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP62P37198 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP62P37198 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP62P37198 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP62P37198 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP62P37198 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP62P37198 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP62P37198 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP62P37198 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP62P37198 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP62P37198 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP62P37198 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP62P37198 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP62P37198 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP62P37198 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP62P37198 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP62P37198 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP62P37198 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP62P37198 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP62P37198 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP62P37198 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP62P37198 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP62P37198 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP62P37198 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP62P37198 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP62P37198 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP62P37198 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP62P37198 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP62P37198 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP62P37198 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP62P37198 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP62P37198 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP62P37198 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP62P37198 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP62P37198 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP62P37198 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP62P37198 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP62P37198 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP62P37198 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP62P37198 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP62P37198 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP62P37198 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP62P37198 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP62P37198 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP62P37198 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP62P37198 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP62P37198 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP62P37198 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NUP62P37198 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP62P37198 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NUP62P37198 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NUP62P37198 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP62P37198 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP62P37198 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP62P37198 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP62P37198 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP62P37198 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP62P37198 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP62P37198 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP62P37198 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP62P37198 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP62P37198 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP62P37198 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms