Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINF1P36955 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINF1P36955 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINF1P36955 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINF1P36955 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms