Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS4P35443 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS4P35443 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS4P35443 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS4P35443 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS4P35443 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS4P35443 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THBS4P35443 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THBS4P35443 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THBS4P35443 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS4P35443 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS4P35443 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS4P35443 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS4P35443 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS4P35443 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS4P35443 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS4P35443 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THBS4P35443 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS4P35443 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS4P35443 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS4P35443 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS4P35443 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS4P35443 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS4P35443 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THBS4P35443 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THBS4P35443 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS4P35443 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS4P35443 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS4P35443 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS4P35443 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS4P35443 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS4P35443 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS4P35443 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THBS4P35443 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THBS4P35443 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THBS4P35443 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS4P35443 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS4P35443 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS4P35443 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS4P35443 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS4P35443 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS4P35443 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS4P35443 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THBS4P35443 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THBS4P35443 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THBS4P35443 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THBS4P35443 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THBS4P35443 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THBS4P35443 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS4P35443 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS4P35443 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS4P35443 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS4P35443 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS4P35443 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS4P35443 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS4P35443 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS4P35443 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS4P35443 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS4P35443 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THBS4P35443 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THBS4P35443 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THBS4P35443 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THBS4P35443 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THBS4P35443 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS4P35443 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS4P35443 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS4P35443 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS4P35443 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS4P35443 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS4P35443 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS4P35443 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS4P35443 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS4P35443 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS4P35443 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS4P35443 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
THBS4P35443 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THBS4P35443 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBS4P35443 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBS4P35443 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBS4P35443 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBS4P35443 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS4P35443 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS4P35443 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS4P35443 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS4P35443 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS4P35443 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS4P35443 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS4P35443 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THBS4P35443 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THBS4P35443 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBS4P35443 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBS4P35443 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBS4P35443 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBS4P35443 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBS4P35443 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THBS4P35443 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS4P35443 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS4P35443 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS4P35443 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THBS4P35443 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms