Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXC8P31273 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXC8P31273 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXC8P31273 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXC8P31273 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXC8P31273 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXC8P31273 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXC8P31273 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXC8P31273 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXC8P31273 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXC8P31273 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXC8P31273 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXC8P31273 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXC8P31273 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXC8P31273 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXC8P31273 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXC8P31273 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXC8P31273 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXC8P31273 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXC8P31273 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXC8P31273 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HOXC8P31273 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXC8P31273 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC8P31273 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXC8P31273 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms