Protein–RNA interactions for Protein: P29590

PML, Protein PML, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMLP29590 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PMLP29590 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PMLP29590 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PMLP29590 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PMLP29590 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PMLP29590 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PMLP29590 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PMLP29590 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PMLP29590 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PMLP29590 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PMLP29590 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PMLP29590 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PMLP29590 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PMLP29590 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMLP29590 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMLP29590 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMLP29590 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMLP29590 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMLP29590 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMLP29590 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMLP29590 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PMLP29590 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMLP29590 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMLP29590 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PMLP29590 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMLP29590 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMLP29590 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMLP29590 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMLP29590 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMLP29590 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMLP29590 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMLP29590 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMLP29590 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMLP29590 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMLP29590 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMLP29590 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMLP29590 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMLP29590 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMLP29590 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMLP29590 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMLP29590 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMLP29590 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMLP29590 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMLP29590 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMLP29590 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMLP29590 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMLP29590 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMLP29590 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMLP29590 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMLP29590 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMLP29590 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMLP29590 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMLP29590 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMLP29590 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMLP29590 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMLP29590 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMLP29590 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMLP29590 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMLP29590 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMLP29590 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMLP29590 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMLP29590 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMLP29590 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMLP29590 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMLP29590 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMLP29590 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PMLP29590 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PMLP29590 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMLP29590 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMLP29590 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMLP29590 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMLP29590 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMLP29590 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMLP29590 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMLP29590 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMLP29590 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMLP29590 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMLP29590 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMLP29590 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMLP29590 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PMLP29590 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMLP29590 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMLP29590 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMLP29590 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMLP29590 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMLP29590 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMLP29590 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMLP29590 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMLP29590 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMLP29590 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMLP29590 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMLP29590 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMLP29590 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMLP29590 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMLP29590 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMLP29590 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMLP29590 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMLP29590 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PMLP29590 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PMLP29590 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms