Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PTPRMP28827 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PTPRMP28827 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
PTPRMP28827 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
PTPRMP28827 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PTPRMP28827 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PTPRMP28827 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRMP28827 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRMP28827 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRMP28827 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRMP28827 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PTPRMP28827 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PTPRMP28827 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PTPRMP28827 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PTPRMP28827 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PTPRMP28827 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PTPRMP28827 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PTPRMP28827 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PTPRMP28827 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRMP28827 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRMP28827 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PTPRMP28827 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
PTPRMP28827 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PTPRMP28827 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PTPRMP28827 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PTPRMP28827 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PTPRMP28827 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
PTPRMP28827 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PTPRMP28827 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
PTPRMP28827 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PTPRMP28827 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PTPRMP28827 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PTPRMP28827 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PTPRMP28827 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRMP28827 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRMP28827 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRMP28827 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PTPRMP28827 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
PTPRMP28827 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PTPRMP28827 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PTPRMP28827 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
PTPRMP28827 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PTPRMP28827 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
PTPRMP28827 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
PTPRMP28827 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
PTPRMP28827 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
PTPRMP28827 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
PTPRMP28827 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PTPRMP28827 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
PTPRMP28827 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PTPRMP28827 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
PTPRMP28827 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
PTPRMP28827 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PTPRMP28827 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PTPRMP28827 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PTPRMP28827 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PTPRMP28827 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PTPRMP28827 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PTPRMP28827 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PTPRMP28827 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PTPRMP28827 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PTPRMP28827 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PTPRMP28827 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PTPRMP28827 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PTPRMP28827 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PTPRMP28827 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PTPRMP28827 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PTPRMP28827 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PTPRMP28827 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PTPRMP28827 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PTPRMP28827 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PTPRMP28827 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PTPRMP28827 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PTPRMP28827 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
PTPRMP28827 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PTPRMP28827 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PTPRMP28827 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PTPRMP28827 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PTPRMP28827 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PTPRMP28827 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PTPRMP28827 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PTPRMP28827 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PTPRMP28827 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PTPRMP28827 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms