Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LOXP28300 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LOXP28300 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LOXP28300 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LOXP28300 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LOXP28300 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LOXP28300 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LOXP28300 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LOXP28300 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LOXP28300 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LOXP28300 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LOXP28300 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LOXP28300 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LOXP28300 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LOXP28300 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LOXP28300 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LOXP28300 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LOXP28300 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LOXP28300 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LOXP28300 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LOXP28300 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LOXP28300 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LOXP28300 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LOXP28300 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LOXP28300 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LOXP28300 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LOXP28300 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LOXP28300 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LOXP28300 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LOXP28300 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LOXP28300 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LOXP28300 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LOXP28300 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LOXP28300 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXP28300 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXP28300 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXP28300 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOXP28300 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOXP28300 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LOXP28300 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOXP28300 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOXP28300 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOXP28300 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LOXP28300 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOXP28300 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOXP28300 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOXP28300 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LOXP28300 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOXP28300 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOXP28300 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXP28300 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXP28300 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXP28300 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXP28300 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXP28300 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXP28300 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXP28300 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXP28300 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXP28300 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXP28300 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXP28300 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXP28300 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXP28300 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXP28300 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXP28300 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXP28300 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOXP28300 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOXP28300 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOXP28300 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOXP28300 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOXP28300 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LOXP28300 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LOXP28300 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LOXP28300 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LOXP28300 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LOXP28300 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LOXP28300 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LOXP28300 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LOXP28300 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LOXP28300 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LOXP28300 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LOXP28300 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LOXP28300 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LOXP28300 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LOXP28300 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LOXP28300 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LOXP28300 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LOXP28300 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LOXP28300 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LOXP28300 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LOXP28300 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LOXP28300 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LOXP28300 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LOXP28300 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LOXP28300 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LOXP28300 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LOXP28300 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LOXP28300 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LOXP28300 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LOXP28300 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms