Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GADD45AP24522 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45AP24522 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45AP24522 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45AP24522 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms